Le séquençage est l'une des clés de la lutte contre le Covid
Depuis de début de la pandémie, des dizaines de variants sont apparus, dont certains ont été détectés au Togo.
Depuis de début de la pandémie, des dizaines de variants sont apparus, dont certains ont été détectés au Togo.
Si aujourd’hui le Delta domine, Omicron pourrait éventuellement le remplacer. Son évolution est observée avec attention partout dans le monde.
Aucun cas signalé à ce jour au Togo. Mais la prudence reste de mise
Les séquençages sont réalisés pour identifier la nature des souches, explique le Dr Hamadi Assane, directeur des programmes de Santé publique.
Un test PCR ou antigénique renseigne sur le fait d’être positif – ou non – au coronavirus, mais il n’indique pas la souche de contamination : variant Delta, Omicron, Alpha, souche originelle ?
C’est cette imprécision qui rend difficile la mesure des nouveaux variants au Togo.
Pour connaître la souche précise, il faut donc aller à l’étape plus loin, le séquençage. Celui-ci est possible sur tout test PCR de bonne qualité ayant récolté suffisamment de matière, ce qui est le cas dans la majorité des tests.
Le séquençage sert à décrypter totalement le génome d’un organisme.
Il permet ainsi déterminer la séquence exacte – représentée par une suite de lettres – composant le virus.
Cette technique à l’avantage de permettre d’identifier l’apparition d’éventuelles mutations par rapport à la souche d’origine.
Même si le génome des virus n’est pas très long, la technique met plusieurs jours à donner son verdict, ce qui rend son déploiement plus lent.
C’est pour cela qu’il faut à chaque fois plusieurs jours pour déterminer si oui ou non un tel cas suspect est bien contaminé par Omicron ou par un autre variant. Sans compter un coût de matériel important lorsqu’on veut repérer beaucoup de cas, comme actuellement.